Theo Lực lượng Bảo vệ bờ biển Nhật Bản, vụ việc diễn ra lúc 8h15 giờ địa phương (6h15 giờ Việt Nam). Tàu chở sỏi trọng tải 492 tấn, với 5 thủy thủ trên boong, đã va chạm với một du thuyền. Toàn bộ thủy thủ trên tàu chở sỏi an toàn.
Hiện chưa rõ số lượng người có mặt trên du thuyền vào thời điểm xảy ra tai nạn. Đến 10h cùng ngày, lực lượng cứu hộ tìm thấy một người đàn ông khoảng 50 tuổi trong tình trạng không còn dấu hiệu sự sống và đã đưa vào bệnh viện. Công tác tìm kiếm những người được cho là mất tích vẫn đang khẩn trương tiến hành.

Cơ quan chức năng cho biết, khi tai nạn xảy ra, mặt biển lặng nhưng tầm nhìn kém, có thể là yếu tố góp phần dẫn tới va chạm. Nguyên nhân vụ việc đang được điều tra.
Lực lượng cứu hộ Nhật Bản đang huy động tàu tuần tra, xuồng cao tốc và thợ lặn để tìm kiếm các nạn nhân, đồng thời xác minh thông tin về du thuyền liên quan trong vụ việc. Đây là vụ tai nạn đường thủy nghiêm trọng mới nhất tại khu vực, làm dấy lên lo ngại về an toàn hàng hải trong điều kiện thời tiết và tầm nhìn hạn chế.